El físico Tanmoy Bhattacharya y el investigador especializado en el HIV Bette Korber están creando un árbol genético evolutivo basado en muestras tomadas por el Center for HIV/AIDS Vaccine Immunology, con el fin de comparar la historia de la evolución de más de 10.000 secuencias de más de 400 personas con el virus del SIDA .
Si pueden identificar características comunes de los virus que se transmiten, los investigadores podrían ser capaces de crear una vacuna que reconozca el virus antes de que el sistema inmunológico del cuerpo se vea afectado.
Roadrunner, desarrollado por IBM para el Departamento de Energía, y ocupando unos 6.000 metros cuadrados en el Laboratorio Nacional Los Álamos en Nuevo México, es la primer computadora en romper la barrera del petaflop, es decir que realizó más de un millón de millones de cálculos por segundo.
El superordenador les da a los investigadores la capacidad de buscar similitudes entre toda la población de pacientes agudos. En esta escala, pueden empezar a entender la relación entre las infecciones crónicas y agudas a partir de estadísticas determinar las ramas de interconexión, y son en estas interconexiones, donde una vacuna especialmente diseñada podría ser más eficaz.
Además de ayudar a mapear el árbol genético del VIH, Roadrunner también acaba de simular el Big Bang, en un intento de comprender mejor la materia oscura, el cálculo de la física detrás de 64 mil millones proto-galaxias, cada una del tamaño de un mil millones de soles, es una tarea que sin dudas requiere una potencia de cálculo fenomenal.
Y algo para tener en cuenta sobre la importancia de estos estudios, es que, en el ejemplo anterior los resultados de Roadrunner predijo cinco veces más materia oscura de la que que los astrónomos han observado hasta ahora.
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